Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms