Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms