Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms