Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC153Q494R4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms