Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
KRTAP13-4Q3LI77 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP13-4Q3LI77 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms