Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF8Q3BBV2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF8Q3BBV2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms