Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFAF6Q330K2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms