Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL40Q2TBA0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms