Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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