Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PDK4Q16654 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PDK4Q16654 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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PDK4Q16654 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PDK4Q16654 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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PDK4Q16654 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PDK4Q16654 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PDK4Q16654 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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