Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CNGA3Q16281 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA3Q16281 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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