Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIK4Q16099 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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