Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms