Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms