Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3CQ15386 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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