Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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