Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPRHQ149N8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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