Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NFIXQ14938 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NFIXQ14938 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms