Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSPNQ14714 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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SSPNQ14714 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSPNQ14714 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSPNQ14714 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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