Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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