Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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