Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SCARF1Q14162 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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