Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL9A3Q14050 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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