Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNGB1Q14028 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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