Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK13Q14004 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms