Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBA3CQ13748 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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