Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH18Q13634 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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