Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BFSP2Q13515 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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