Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF5Q13243 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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