Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CHAF1BQ13112 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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