Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNIP3Q12983 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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