Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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