Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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