Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CNTN1Q12860 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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CNTN1Q12860 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CNTN1Q12860 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CNTN1Q12860 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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