Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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STX4Q12846 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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STX4Q12846 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
STX4Q12846 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
STX4Q12846 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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