Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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