Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms