Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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KCNMA1Q12791 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNMA1Q12791 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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