Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYP4F3Q08477 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms