Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXM1Q08050 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms