Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHRNB3Q05901 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms