Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms