Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MCCD1P59942 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms