Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TPTEP56180 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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