Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH13P55290 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDH13P55290 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDH13P55290 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms