Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASP9P55211 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms