Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EMP3P54852 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EMP3P54852 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EMP3P54852 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms