Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP12AP54707 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms