Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BRCA2P51587 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms