Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSRP3P50461 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms